Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0U1RQJ8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQJ8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQJ8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms