Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RQF3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms