| PTPRJ | Q12913 | APOL4-202 | ENST00000332987 | 1825 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 12.4 | □□□□□ -0.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ARHGAP31-201 | ENST00000264245 | 9317 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.4 | □□□□□ -0.42 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TP53TG3E-202 | ENST00000623491 | 2026 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 12.4 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ARHGAP6-205 | ENST00000380736 | 3883 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.4 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF433-203 | ENST00000419886 | 2322 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.4 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC114811.2-201 | ENST00000569927 | 5647 nt | BASIC | 12.4 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DRC7-202 | ENST00000360716 | 3041 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF75D-202 | ENST00000370766 | 5592 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CYFIP1-207 | ENST00000617556 | 5674 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IMMP1L-201 | ENST00000278200 | 795 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GPHA2-201 | ENST00000279168 | 747 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC01518-201 | ENST00000411439 | 519 nt | TSL 2 BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | GUSBP1-201 | ENST00000449061 | 758 nt | BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC121251.1-201 | ENST00000451481 | 249 nt | BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC112722.1-201 | ENST00000514884 | 587 nt | TSL 4 BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AL513165.2-203 | ENST00000537239 | 717 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC009119.3-202 | ENST00000566773 | 196 nt | TSL 3 BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AL512310.2-201 | ENST00000547175 | 1493 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC02297-201 | ENST00000548050 | 1493 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TGM5-202 | ENST00000349114 | 1958 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | EIF3D-201 | ENST00000216190 | 2155 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AC024568.1-201 | ENST00000517330 | 2260 nt | BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CICP3-201 | ENST00000440782 | 2455 nt | BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TXNL4B-201 | ENST00000268483 | 2556 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FP565260.1-201 | ENST00000617716 | 3264 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PLEKHG5-204 | ENST00000377732 | 3753 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MAGEL2-201 | ENST00000532292 | 4298 nt | APPRIS P1 BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FOXJ3-201 | ENST00000361346 | 5225 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PAX9-201 | ENST00000361487 | 4514 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF655-204 | ENST00000394163 | 4528 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LRP2-202 | ENST00000443831 | 4007 nt | TSL 2 BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ANKRD20A2-201 | ENST00000377601 | 3511 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CHP1-201 | ENST00000334660 | 3329 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PSMB2-201 | ENST00000373237 | 2701 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL445471.2-201 | ENST00000568143 | 2443 nt | BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | EIF2A-214 | ENST00000487799 | 1913 nt | TSL 2 BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | SPTB-202 | ENST00000389720 | 6321 nt | TSL 5 BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PCDHGA7-202 | ENST00000617050 | 3262 nt | APPRIS P1 BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KCNV1-202 | ENST00000524391 | 6979 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | PARD3B-202 | ENST00000351153 | 3411 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL078459.1-201 | ENST00000427819 | 1950 nt | TSL 2 BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | ASS1-201 | ENST00000352480 | 1564 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.39 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | STAG1-203 | ENST00000434713 | 5064 nt | TSL 5 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF646-201 | ENST00000300850 | 6892 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | C22orf31-201 | ENST00000216071 | 995 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | WISP1-201 | ENST00000220856 | 1205 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SGK494-201 | ENST00000301037 | 1233 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CD79B-202 | ENST00000349817 | 378 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RPLP0-203 | ENST00000392514 | 1218 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SFXN5-202 | ENST00000410065 | 840 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GRTP1-AS1-202 | ENST00000423246 | 465 nt | TSL 5 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HSPB1-202 | ENST00000429938 | 527 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC112778.1-201 | ENST00000433306 | 827 nt | BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL627082.1-201 | ENST00000443847 | 235 nt | BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC017006.1-201 | ENST00000450080 | 364 nt | TSL 4 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC119749.1-201 | ENST00000454884 | 691 nt | BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RN7SL299P-201 | ENST00000464573 | 280 nt | BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LAIR1-217 | ENST00000474878 | 814 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RN7SL229P-201 | ENST00000495651 | 299 nt | BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GUSBP8-201 | ENST00000502652 | 679 nt | BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RAB30-AS1-205 | ENST00000530270 | 1116 nt | TSL 2 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP001931.1-201 | ENST00000531074 | 580 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC099524.1-205 | ENST00000562180 | 674 nt | TSL 5 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL592146.2-201 | ENST00000565388 | 444 nt | TSL 5 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC106736.1-201 | ENST00000567721 | 434 nt | TSL 2 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC01517-202 | ENST00000611112 | 539 nt | TSL 5 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | UMPS-211 | ENST00000628619 | 228 nt | TSL 5 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SZRD1-201 | ENST00000401088 | 3636 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAM222B-209 | ENST00000581407 | 4161 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DRD1-201 | ENST00000393752 | 4054 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RRBP1-210 | ENST00000610403 | 3309 nt | TSL 5 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GAS8-220 | ENST00000620723 | 3308 nt | TSL 2 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FKBP9P1-202 | ENST00000455909 | 2451 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF773-205 | ENST00000599847 | 5832 nt | TSL 2 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CTBP2-201 | ENST00000309035 | 3669 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DLGAP1-212 | ENST00000515196 | 5314 nt | TSL 2 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HGSNAT-201 | ENST00000379644 | 5236 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CTCFL-218 | ENST00000608440 | 2749 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | OLFML2B-201 | ENST00000294794 | 3160 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GDI2-202 | ENST00000380181 | 1408 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | BX005040.3-201 | ENST00000611332 | 1988 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | STYX-201 | ENST00000354586 | 4857 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LARP1-201 | ENST00000336314 | 6595 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MICAL2-201 | ENST00000256194 | 3906 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MIR99AHG-220 | ENST00000635845 | 1588 nt | TSL 5 BASIC | 12.38 | □□□□□ -0.43 | | |