Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
U3KQE9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U3KQE9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U3KQE9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U3KQE9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U3KQE9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U3KQE9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U3KQE9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U3KQE9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
U3KQE9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U3KQE9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
U3KQE9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
U3KQE9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
U3KQE9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
U3KQE9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
U3KQE9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
U3KQE9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
U3KQE9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
U3KQE9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
U3KQE9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
U3KQE9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms