Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A4Q9Y6R1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A4Q9Y6R1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC4A4Q9Y6R1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 987.3 ms