Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms