Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E2

PCDHB7, Protocadherin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB7Q9Y5E2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHB7Q9Y5E2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHB7Q9Y5E2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHB7Q9Y5E2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB7Q9Y5E2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHB7Q9Y5E2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHB7Q9Y5E2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHB7Q9Y5E2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHB7Q9Y5E2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHB7Q9Y5E2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB7Q9Y5E2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB7Q9Y5E2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB7Q9Y5E2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB7Q9Y5E2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB7Q9Y5E2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB7Q9Y5E2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB7Q9Y5E2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms