Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HDGFL3Q9Y3E1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms