Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED5Q9Y3A6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms