Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED16Q9Y2X0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MED16Q9Y2X0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.8 ms