Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUDCQ9Y266 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUDCQ9Y266 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms