Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEU3Q9UQ49 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEU3Q9UQ49 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEU3Q9UQ49 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEU3Q9UQ49 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEU3Q9UQ49 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms