Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
L1RE1Q9UN81 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms