Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DENND2AQ9ULE3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms