Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PACSIN3Q9UKS6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3Q9UKS6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms