Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPN3Q9UHW5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPN3Q9UHW5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms