Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CFDP1Q9UEE9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CFDP1Q9UEE9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CFDP1Q9UEE9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms