Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP2Q9UDT6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIP2Q9UDT6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms