Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF1Q9UBU9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF1Q9UBU9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms