Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUCLA2Q9P2R7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUCLA2Q9P2R7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUCLA2Q9P2R7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUCLA2Q9P2R7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUCLA2Q9P2R7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUCLA2Q9P2R7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUCLA2Q9P2R7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUCLA2Q9P2R7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUCLA2Q9P2R7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms