Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL13Q9P2N7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms