Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP36Q9P275 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms