Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC88CQ9P219 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC88CQ9P219 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC88CQ9P219 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms