Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC44.47■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CCDC180Q9P1Z9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC44.44■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC44.41■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC44.39■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
CCDC180Q9P1Z9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC44.38■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC44.37■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC44.36■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC44.32■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
CCDC180Q9P1Z9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
CCDC180Q9P1Z9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms