Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NKIRAS1Q9NYS0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms