Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARHL2Q9NY43 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms