Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKN2AIPQ9NXV6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms