Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF38Q9NXL2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms