Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVAQ9NVD7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVAQ9NVD7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms