Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GINM1Q9NU53 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GINM1Q9NU53 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms