Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PDS5BQ9NTI5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
PDS5BQ9NTI5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PDS5BQ9NTI5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms