Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTNNBIP1Q9NSA3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms