Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC22A11Q9NSA0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC22A11Q9NSA0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms