Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HELLSQ9NRZ9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HELLSQ9NRZ9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms