Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGEF4Q9NR80 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF4Q9NR80 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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