Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM7Q9NR12 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms