Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRPV4Q9HBA0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRPV4Q9HBA0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms