Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C5orf42Q9H799 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf42Q9H799 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf42Q9H799 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms