Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSUN3Q9H649 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSUN3Q9H649 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NSUN3Q9H649 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSUN3Q9H649 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSUN3Q9H649 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSUN3Q9H649 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NSUN3Q9H649 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms