Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDCBP2Q9H190 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms