Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AMBRA1Q9C0C7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
AMBRA1Q9C0C7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms