Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXP3Q9BZS1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXP3Q9BZS1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms