Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDCA4Q9BXL8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDCA4Q9BXL8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms