Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
REPIN1Q9BWE0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms