Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIOK2Q9BVS4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RIOK2Q9BVS4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms