Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
THUMPD3Q9BV44 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms