Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA3Q9BTC8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA3Q9BTC8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms