Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TIMM29Q9BSF4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TIMM29Q9BSF4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms