Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR10

SPATA25, Spermatogenesis-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA25Q9BR10 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPATA25Q9BR10 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPATA25Q9BR10 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPATA25Q9BR10 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPATA25Q9BR10 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPATA25Q9BR10 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPATA25Q9BR10 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPATA25Q9BR10 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms