Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MGME1Q9BQP7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MGME1Q9BQP7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms